病原微生物的种类较多，有真菌，细菌、病毒，立克次体，原生动物和线虫等，其中以真菌、细菌和病毒应用较为广泛。一、细菌：以芽孢杆菌、无芽孢杆菌、球杆菌研究最多。芽孢杆菌能产生芽孢抵抗不良环境，并且在生长发育过程中能形成具有蛋白质毒素的伴孢晶体，对多种昆虫，尤其是对鳞翅目昆虫有很强的毒杀作用，目前，国内外普遍应用的细菌杀虫剂有苏云金杆菌、青虫菌B、日本金龟子流乳病菌（包括日本金龟子芽孢杆菌B和慢死芽孢杆菌B两种）等。二、真菌：昆虫被真菌侵入致病死后虫体僵硬，称为硬化病。目前广泛应用的有白僵菌、绿僵菌、虫霉、赤座霉和蜡蚧轮枝菌。我国利用白僵菌防治大豆食心虫、玉米螟、地老虎、松毛虫、蛴螬、甜菜象甲、甘蓝夜蛾、甘薯小象甲、红蜘蛛、蓟马、叶蝉等数十种害虫，均取得了不同程度的防治效果。三、病毒：是近年来发展较快的一个病原物类群，对害虫有专一性，且在一定条件下能反复感染。据报道昆虫和螨类的病毒约1000多种，其中以鳞翅目昆虫病毒最多，如棉铃虫核多角体病毒已制成杀虫剂，并已大面积使用防治棉铃虫。