绿色食品贮藏要求不能使用对食品产生污染或潜在污染的建筑材料与物品；贮藏设施应具有防虫、防鼠、防鸟的功能；周围环境应清洁和卫生，并远离污染源。设施及其四周要定期打扫和消毒；贮藏设备及使用工具在使用前均应进行清理和消毒，防止污染；优先使用物理或机械的方法进行消毒。堆放应按绿色食品的种类要求选择相应的贮藏设施存放整齐，保证绿色食品的质量不受影响；不能与非绿色食品或有毒、有害、有异味、易污染物品混放或同库存放。保质处理应优先采用紫外光消毒等物理与机械的方法和措施。另外，管理和工作人员必须遵守卫生操作规定；所有的设备在工作和使用前均要进行灭菌，防止污染。仓库管理必须优先采用物理与机械的方法和措施，采用干燥、低温、密闭与通风、缺氧（充二氧化碳或氮气）、紫外光消毒等物理或机械方法。