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自然发酵的菌种来源主要为依附在发酵物上面的天然野生酵母菌。自然发酵是利用自然环境中的微生物进行发酵的一个过程，比如谷类可以靠天然野生菌种进行自然发酵，而发酵过的面食不但较为松软而且容易消化，同时其含有的矿物质在酸化的过程中会变得更加容易被吸收和利用。
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