沃土是最佳类型的土壤，因为它含有适量的水、空气和养分，使植物能健康茁壮地生长。而黄连的种植也需要肥沃的土壤。
来自土壤的13种矿质营养元素，可分成三类-大量营养元素：氮、磷钾：中量营养元素：钙、镁、硫：微量营养元素的含量则只占干物质重量的千分之几以至十万分之几，它门是铁、硼、锰、铜、锌、钼、氯7种。
由于黄连生长需要大量营养元素，这些元素通常在土壤中容易出现短缺。中量营养元素和微量营养元素的利用量小，不常表现缺乏。但是在黄连产量提高后，一些中量和微量元素也会缺乏。
另一方面，各种土壤供给养分的能力是不相同的。这主要是受成土母质种类和土壤形成时所处环境条件等因素的影响，使它们在养分的含量上有很大差异。所以土壤的选择对黄连的种植影响很大。
黄连多栽培于半阴半阳、土层深厚，肥沃疏松，排水良好、表层腐殖质含量丰富、下层保水、保肥力较强的土壤比较好。植被为***带常绿阔叶林、针阔叶混交林，除此之外，在二荒地栽植黄连也可以栽培黄连的土壤主要具有四个特点：
首先，富含有机质的腐殖质土，般含有机质7~13%，具水稳性团粒结构，有缓慢释放养分的特点。
其次，土壤多为微酸性，pH值约在5.5~6.5之间，这样才适合黄连的生长。
再次，土壤含钾、氮丰富而缺磷，一般的林地和二荒地含钾量、含氮量都比较丰富。而黄连的生长正需要这些营养元素。
最后，土壤含水量大，有时达42~47%，湿润的土壤才适合黄连的生长。
因为黄连是浅根作物，它的须根大部分分布在5~10厘米的土层中，适宜生长在上层为腐殖质层、肥沃疏松的沙壤土，下层为保水保肥力较强的壤土或黏壤土中，药农称之为“上泡下实”的土壤。耕种帮提醒黄连还不适宜于连作。经研究，种过黄连的土地需经2~3年轮作后，才可继续栽培黄连。
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