基肥又称底肥，是整地、翻耕时施用的肥料。一般可施用单质肥料、复混肥料和有机肥料，以满足作物苗期对多种养分的需求，有利于壮苗，所以基肥充足是获得作物高产的基础。基肥的用量与作物种类、土壤性质等关系密切。有机肥、磷肥、钾肥一般全部以基肥施入，氮肥一般部分以基肥施入。

确定基肥用量应考虑到小麦不同生育期的营养需要。以磷素为例，磷在土壤中易固定，移动性小，小麦生长要避免后期缺磷，保持“旺而不衰”，必须满足磷的需求。基肥用量还要考虑土壤条件，应掌握“瘦地或粘性土多施，肥土和砂性土少施”的原则。因为瘦地苗期易摧肥，而砂性土保肥差，在多雨季节易渗漏，故在施用上宜采用“少量多次”的方法。氮肥的基肥比例，据小麦产量水平而定，中高产地块，一般要求50%的氮素化肥作追肥，其余的全部作基肥。