沼渣中含有丰富的有机物和多种养分元素，是良好的土壤改良剂。可以作基肥、追肥，也可与其他化肥堆沤。一般做基肥，亩用量1500千克左右。耕翻前直接撒施地表，立即耕翻，以利提高肥效。据各地生产调查，亩施湿沼渣1200～1500千克，可增产粮食8.6%～15.9%。连年施用，具有明显的改良土壤作用。沼渣作追肥，亩用量1000～1500千克，在作物根部周围开沟或挖穴施入沼渣，然后覆土，亩增粮8%～12%。沼渣与碳铵、过磷酸钙等堆沤，肥效可显著提高。生产上沼渣、沼液常结合施用（沼液、沼渣，以下简称沼肥），用于作物根部施肥。果树施用沼肥要根据不同树龄采取不同方法。幼树施用沼肥要结合扩穴，以树冠滴水为直径向外呈环形开沟，沟内施肥。以后每年施肥要错位开穴，并且每年向外扩展，以增加根系吸收范围，充分发挥肥效。挂果树施用沼肥，要按辐射状开沟，并轮换错位；开沟不宜太深，不要损伤根系，施肥后覆土。实践证明，果树长期用沼肥根部施肥，树势茂盛，叶色浓绿，病虫害明显减少，抽梢整齐，幼果脱落较少，果实味道纯正，产量比施化肥或普通有机肥明显提高。