病虫害预防不及时是导致减产的重要原因。病理不清和病因不清是导致病虫害高发的原因之一，杀菌剂当杀虫剂打，杀虫剂当杀菌剂打。平时不预防，发现病害乱投医，什么农药都打，有农户轻信农药经销商甚至把叶面肥当做农药打。施肥浇水不当导致产量低的重要原因之一。华宁洋葱种植区总体水源条件较好，许多农户大水漫灌导致病虫害传播迅速，防治不及时造成减产。尿素施用过多，钾肥、微肥施用不足导致减产。自然灾害是影响洋葱减产的重要原因之一。假如云南冬季下了一场大雪、大雨、连续阴雨、严重的霜冻害，都可能出现病虫害加重乃至葱苗死亡，导致严重减产。2015年12月华宁县连下两场雨加雪，雪后加霜，发生严重霜冻害，导致霜霉病、灰霉病爆发，加之防治不及时，许多葱农严重减产。同时，自然灾害会造成洋葱上市时间推迟，品质差。2014年华宁县洋葱价格总体较低的原因跟上市时间推迟、品质差是有很大的关系，同期3月上旬建水、个旧的价格都在50元-70元/袋，而华宁洋葱仅卖30-35元/袋。水旱不轮作，年年小春种植洋葱导致病虫害高发。产业结构调整，大部分农户水改旱，种植蔬菜，蔬菜成为了洋葱种植区农户增收致富的主要产业，一年到头旱作导致病虫害高发减产。在没有市场预测的信息支撑下，大部分农户通过年复一年的种植洋葱来规避市场风险，赚两年亏3年，年年种植洋葱也导致病虫害高发造成减产。