二次发酵，又叫好气性F·B，是指已发酵完成的青贮饲料，在开窖使用后，空气随之进入，通气部分青贮饲料与空气接触，窖内温度急剧升高，好气性微生物酵母菌与霉菌在这样的条件下，大量繁殖而导致青贮料发霉变坏，并产出大量的热。它实质上是一种好气性微生物的F·B现象。品质较好的青贮饲料易发生二次发酵。出现二次发酵后，青贮饲料的糖分可损失10%-24%。若有大量的霉菌活动而发生霉变或产生亚硝酸盐，喂给牛羊后，会造成一定程度的危害。造成青贮饲料二次发酵的主因有：原料收割晚，切段长，装窖不匀，有凹陷，密度不一，装贮时间过长，未压紧，密封差，日取喂量少等。为避免二次发酵所造成的损失，建议养殖户应及时采取应对措施加以预防。