一、选用无病土育苗：在尽可能的情况下，选近几年来未植棉、向阳肥沃地块育苗，减少菌源，减轻病害。二、精选种籽：挑除秕籽、虫籽和烂籽。播前进行晒种，提高棉籽生活力，增强其抗逆力。三、采用14%百枯净可湿性粉剂2000-2500倍液（8-6克药剂/兑水30市升混配40%生物营养液肥25毫升，以下同），拌棉种8—10斤。方法是先将棉种用三开一凉温水浸泡半小时，然后加凉水浸泡8—10小时，抗虫棉浸2小时捞出晾至大半干后再将14%百枯净10克药剂加一斤细干土充分混合后，边拌边撒，把药粉均匀的拌撒在棉籽上，然后播种。切忌用药不能超量和用草木灰拌种，否则将影响出苗。四、棉苗出土后，根据气候变化和病害发生情况，棉苗根腐病与猝倒病分别采用14%百枯净2000-2500倍液混配40%生物营养液肥25毫升泼浇苗床，或14%百枯净1200-1500倍液混加40%生物营养液肥25毫升喷洒。在叶病发生初期，可用14%百枯净1200-1500倍液混加40%生物营养液肥25毫升，移栽前采用16%虫线清400—800倍液（40—20毫升药剂/兑水16公升）喷施苗床可减轻苗期蚜虫、红蜘蛛的危害。五、棉花大田要精细整地，施足底肥。底肥除有机肥外，要注意氮、磷、钾及中微量元素的合理搭配。最好施用广东省珠海市绿宇生化技术研究所研制的生物营养液肥或含氮、磷、钾配比合理的全元有机复合肥，以提高棉花的抗病能力。并采用16%虫线清400—800倍液混配14%百枯净1200倍液拌细土土12-15公斤于播种或移植前进行土壤处理，可有效防治地下害虫及前期的蚜虫、红蜘蛛等。六、植播前和移栽田防治方法相同。除此以外，也可推广地膜覆盖技术，可有效提高地温，减少病害的发生。