高粱黑穗病有三种，即坚黑穗病、散黑穗病、丝黑穗病，以丝黑穗病（乌米）为害为主。病菌由土壤和种子传播，在高粱播种后种子萌发时，病菌的厚垣孢子也同时萌发侵入高粱幼芽里，伴随高粱生长，到高粱幼穗形成时就破坏穗部变成乌米。预防高粱黑穗病，首先应选用抗病品种，目前推广的杂交种中只有吉杂80、吉杂96抗丝黑穗病，其它都不同程度的感染。其次是忌重茬。常年丝黑穗病的发病率0.5-2.0%，个别严重地块可达30%以上。第三是种子包衣或拌种:可在播种前2周进行包衣，目前用40%萎锈灵、10%福美双包衣效果较好。也可用25%的粉锈宁可湿粉，按种子量的0.3-0.5%拌入，防止丝黑穗病、散黑穗病效果很好。另外，近年高粱顶腐病有发展趋势，顶腐病是由镰刀菌引起的，喷洒松酯酸酮加丰产灵，效果较好。