（1）市（县、区）工作机构受理申报主体申请，负责完成申请人申请材料的初审、组织现场检查、产品抽检等；（2）无公害农产品省级工作机构接收《无公害农产品认证申请书》及附报材料后，请专家对材料是否齐全完整、材料内容是否真实准确、生产过程是否有禁用农药等投入品、投入品使用是否规范进行审核，合格的完成无公害农产品产地认定，并颁发《无公害农产品产地认定证书》，并将产品认证材料报农业部相关的种植业及畜牧业分中心；（3）农业部农产品质量安全中心所属专业认证分中心对省级工作机构提交的初审情况和相关申请资料进行复查，对生产记录档案和产品检验报告的符合性进行审查，符合要求的上报部中心；（4）农业部农产品质量安全中心根据专业认证分中心审查情况再次进行形式审查，符合要求的组织召开“认证评审专家会”进行最终评审；（5）农业部农产品质量安全中心颁发无公害农产品质量证书、核发无公害农产品标志，并报农业部和国家认监委联合公告。