既然说园艺式鱼菜共生中应当选择硝化菌，那么，我们就来认识一下硝化菌。硝化菌是利用氨或亚硝酸盐作为主要生存能源，利用二氧化碳作为主要碳源的一类化能自养菌，包括形态互异类型的一种杆菌、球菌以及螺旋型细菌，属于绝对自营性微生物的一类。硝化菌是古老的细菌之一，广泛分布于土壤、淡水、海水及污水处理系统中，却在自然界鲜少大量出现，原因在于硝化菌的分布会受到许多环境因素的影响，如氮源、温度、氧气浓度、渗透压、酸碱度和盐度等等。硝化细菌分为亚硝化菌与硝化菌。亚硝化菌的主要功能是将氨氮转化为亚硝酸盐；硝化菌的主要功能是将亚硝酸盐转化为硝酸盐。氨氮和亚硝酸盐都是水产养殖过程中产生的有毒物质且亚硝酸盐还是强烈的治癌物质，因此如何降解这两种物质，是科学工作者近年来的工作重点。由于亚硝化菌的生长速度比较快且光合细菌也具有降解氨氮的作用，因此现代养殖已能成功地将氨氮控制在较低的水平上。而对于亚硝酸盐，由于自然界中的硝化菌生长极慢且还没有发现有其它的任何微生物可代替硝化菌的功能，自然条件下，硝化和脱氮效果不能满足正常养殖的需要，所以养殖过程中产生的亚硝酸盐就成为阻碍养殖发展的关键因素。亚硝化菌在鱼缸内的表现是可以通过肉眼观察出来的，硝化菌却可以看不出来。只有当亚硝酸盐浓度达到一定程度时，硝化菌才会开始繁衍，过程和亚硝化菌一样，而这个过程大概需要2-3周时间，甚至会更漫长一点。所以要建立一个完整菌落群，没有个把月是不行的。硝化作用必须依赖于自养性硝化细菌来完成。养殖池中有丰富的氮源，原本很适于硝化细菌生长，不过由于养殖池中存在大量的异养菌，受到异养性细菌的排斥作用，适合硝化细菌栖息的地方相对自然环境显然少得多，因此无足够数量的自养性硝化细菌来消费过量的亚硝酸氮，这就是问题所在。硝化菌是生物脱氮过程中起主要作用的微生物，能将水中的有毒的化学物质氨和亚硝酸加以分解去除，故有净化水质的功能，因此在氮循环水质净化过程中扮演着重要的角色。水中硝化菌的数量直接影响硝化效果和生物脱氮效率，硝化菌制剂的浓度与硝化效率成正比。硝化菌已逐渐成为水产养殖界的热门话题，它在水产养殖中的重要性开始引起广泛的注意。可以说，迄今为止，在大规模、集约化的水产养殖模式中，如果没有硝化细菌参与其中的净水作用，想获得成功的养殖是相当困难的。在这里教大家一个自制硝化细菌的办法：一盆净水，一条2两的鲫鱼，最好是健康活鱼弄死，免得带病，把鱼放在盆内，打氧，等鱼F·B，这时会发出臭味，水会浑浊，继续打氧，直到有一天，这盆水突然特别清澈了，那么一盆正宗的硝化细菌已经成功培养出来了，把它倒入缸中就可以了。此法简单经济，唯一需注意的一点是要保持卫生，千万不要拿有病的鱼来培养。需要注意的是，硝化细菌在水质pH中性、弱碱性的环境下发挥效果最佳，在酸性水质中发挥效果最差。硝化作用从5度-35度都可以进行，最适宜的温度是25度。硝化菌不喜光，如果有条件最好制造全黑的环境，但这不是必需条件。