1、防潮化肥吸湿而引起的潮解、结块和养分损失，是贮藏中普遍存在的问题，如碳铵受潮后分解挥发，氮素跑掉，硝酸铵、硝酸磷肥、硝酸钾、硝酸钙、尿素等，以及用这些为原料的混合肥料，都极易吸潮、结块，很难施用并损失大量养分。　　　　存放措施：一是要保持肥料袋完好密封。二是要求库房通风好，不漏水，地面干燥，最好铺上一层防潮的油毯和垫上木板条。　　　　2、防毒　化肥由各种酸、碱、盐组成，1、有的本身有毒，如石灰氮；2、有的在贮存中易挥发游离酸，使库房空气呈酸性，如普钙；3、有的潮解后挥发出的氮气，在空间形成碱性物，如碳铵、氮化铵，硫酸铵以及含铵态氮的复合肥。　　　　存放措施：查看时带好口罩和手套，库房要通风，相对湿度要低于70%，当库房内温度和湿度都高于库外时，可以在晴天的早晚打开库房的门窗进行自然通风调节。　　　　3、防火防爆　硝酸铵、硝酸钾等是制造火药的原料，在日光下暴晒、撞击或高温影响下会发热、自然爆炸，这类化肥贮藏时不要与易燃物品接触，化肥堆放时不要堆得过高，码垛时以不超过1.5米为宜，库房要严禁烟火，并设置消防设备，以保安全。