防治纹枯病必须以肥、水管理为中心，结合喷药保护。①打捞菌核，减少菌源在本田翻耕灌水耙平时，多数菌核浮于水面，混杂在“浪渣”内，被风吹到田边或田角，可用打捞工具打捞“浪渣”内菌核，并带出田外深埋或晒干后烧毁。还应注意铲除田边杂草，及时拔除田中稗草，防止病稻草归田②湿润灌溉，适时烤田必须根据水稻生长发育状况和气候条件，在比较多肥密植的情况下，分蘖末期以前应以浅水勤灌，结合适当排水露田为宜；分蘖期及时烤田，控制无效分蘖，促使水稻青秀老健。③合理施肥，增强抗病力总的要掌握基肥足、追肥早，基、追肥比例恰当的原则。在施肥种类上，要以有机肥和化肥相结合，注意氮、磷、钾配合施用，切忌过施、偏施氮肥。④适期喷药保护一般应在病害水平扩展阶段及时用药。可用50%退菌特可湿性粉剂，每公顷750克加水1125公斤喷雾；用70%甲基托布津可湿性粉剂每公顷1125克，或50%多菌灵可湿性粉剂每公顷1125-1500克加水1125公斤喷雾。抗菌素主要是5%井岗霉素水剂防治效果比较理想，每次每公顷1500毫升，喷洒于禾苗下部。