1、随出随施，不宜久存：即从沼气池里取出来，直接挑到田里施用，如果忙不过来，也只能在池外堆一两天，时间久了，速效氮会挥发掉。实验表明，沼气渣肥在露天堆放晒干，全氮损失65为%左右，氨态氮损失87%。2、沼渣宜作基肥：沼渣作基肥深施，最好集中施用如穴施、沟施，然后覆盖一层10厘米左右厚的土，以减少速效养分的挥发。3、沼液宜作追肥：应根据沼液的质量和作物生长情况，掺水冲稀，以免伤害作物的幼根、嫩叶。4、沼肥与化肥配合施用：氨水和碳酸氢铵是生产成本较低的氮素肥料，呈碱性，易挥发损失。沼液与氨水、碳酸氢铵配合施用，能帮助化肥在土壤中溶解，吸附和刺激作物吸收养分，并提高化肥利用率。可在每50公斤沼液中加入0.5-1公斤碳酸氢铵或氨水施用。沼渣与过磷酸钙混合施用，也能提高过磷酸钙的肥效。