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病原为黏孢子虫。孢子虫侵袭鱼的皮肤、鳃、鳍条等，寄生处形成胞囊，体表黏液增多，病情越发展，胞囊越大，数量越多。若寄生在鳃部则引起鳃丝严重浮肿，鳃片增生融合，呼吸困难。病鱼流动迟缓，体色变黑，日渐瘦弱。对孢子虫病主要是预防，放鱼前每亩鱼池用生石灰150千克清塘，杀灭藏在泥土中的黏孢子虫。
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