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桃树白绢病发病部位主要在果树或苗木的根颈部，以在距地表5—10厘米处多。发病初期，根颈表面形成白色丝状物，表皮呈现水渍状褐色病斑，后来根颈全部覆盖着如丝绢状的白色层状物。
在潮湿的条件下，它们能蔓延至病部周围的地面，当病部进一步展时，根颈部的皮层腐烂，有酒糟味，并溢出褐色汁液。后期在病部或者附近的地表裂缝中长出许多棕褐色或茶褐色油菜籽状的核状物。
病株地上部的症状表现是叶片变小发黄，枝条节间缩短，结果多而小。茎基部皮层腐烂，病斑环绕树干后，在夏季会突然全株枯死。
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