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西瓜根结线虫是西瓜根腐病的可能原因之一。根结线虫对根部有害。当它侵染根部时，其分泌物(唾液)进入根部后会发生化学反应，导致西瓜根部长出大小不一的块根，阻碍根部吸收土壤中的养分和水分。如果长期不能吸水，根部就会腐烂，也就是我们所说的烂根。此外，当根结线虫侵染根部时，会用口针刺破根部组织，也会带来其他病菌，如西瓜茎腐病，也可能引起西瓜根腐病。
因此，建议农民做好西瓜根结线虫的防治工作。可以通过药物控制。西瓜移栽前，在沟内·穴内或大田施用利根杀颗粒剂，有效期为2-3个月。如果西瓜处于生长期，可以用壮根剂(壮根剂/根灵)的溶液浇灌根部。
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