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根系由乳白色变为红褐色，无新根，不生长，植株生长缓慢，幼苗萎蔫。主要是床土低温高湿造成的。在连续阴雨天的环境条件下更容易发生根腐病。另外，连作地块容易导致西瓜根腐病。
预防措施：改善育苗环境条件，早春采用电温床或生物酿造温床育苗；控制浇水，尤其是在雨天；对于烂根较轻的瓜苗，可通过苗床松土·撒草木灰等方式，提高温度，降低湿度，帮助瓜苗尽快复壮生长；西瓜幼苗长出新根后，浇4000倍的802和100倍的尿素混合液，促进西瓜根系生长发育。
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