抗病性好、产量高、品质优的朝天椒杂交一代品种逐渐替代传统自交品种。由于朝天椒在我国的种植面积逐渐扩大,已经发展成为一些地区的主要经济作物,国内外许多育种研究所和公司都在积极开展朝天椒的选育工作,近几年陆续推出了许多新品种。来自国内的品种主要有:国塔106、国塔116、七姊妹、一串红、博辣、天骄、博辣、天星、金冠、星秀、红秀、湘辣706、川椒子弹头、天辉、火炬、火焰、天盛、天盛、天辉、傲雪干椒王、千斤櫻仔、红玉、海花六号、橙色朝天椒、艳红99、天玉一号、天玉二号、红升、红香玉、天福、圣火、天王星、天王星3号、黔辣2号、黔辣3号、黔辣4号、黔辣5号、单生贵族、鸿丰辣王、朝天贵族等。引进国外公司的品种有:艳红、天宇三号、天升、单生1号、单生618、簇生-958、飞鹰一号、天女散花、韩国白米椒、韩国米辣王等。除此之外,我国云南省和贵州省有丰富的朝天椒资源,种植面积较大的地方品种主要是贵州小椒(圆锥形椒)。当年从曰本引进的三櫻椒,也叫三鹰椒或天鹰椒,这类簇生朝天椒品种目前在河南地区仍有较大面积种植。