花生荚果贮藏过夏，需将水分控制在9%~10%以下。干燥的荚果在冬季通风降温后，趁低温密闭贮藏。高水分的荚果可用小囤贮存过冬，经过通风干燥后，第2年春暖前再人仓密闭保管。如水分超过15%，在冬季低温条件下，易遭受冻害，必须设法降低水分，才能贮藏。
种用花生一般以荚果贮藏为妥。最好在晒干以后，先摊开通风降温，待气温降至10℃以下时，再入仓贮藏，以防止早期入仓发热。花生入仓初期，尚未完成后熟，呼吸强度大，需注意通风降温，否则可能造成闷仓闷垛的异常情况，严重影响发芽率。在次年播种前，不宜脱壳过早，否则会影响发芽率，一般应在播种前10天脱壳。
留种花生荚果最好用袋装法贮藏，剔除破损粒及嫩粒，水分在9%~10%，堆垛温度不宜超过 25℃。如进行短期保藏，可采用散装贮藏，堆内设置通气筒，堆高不超过2m(不论脱壳与否，均不耐压)。
从安全贮藏角度看，荚果贮藏具有许多优越性：种子有荚壳保护，不易被虫蛀为害;荚果组织疏松，一经晒干，不易吸潮，受不良气候条件影响较小，生活力可以保持较久;对检查和播种前的选种工作较为方便，特别是鉴定种子的品种纯度和真实性等。其唯一缺点就是体积较大，比种仁贮藏需多占仓容2倍以上。
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