李子在贮藏期间的侵染性病害主要有褐腐病和软腐病。褐腐病多在田间侵染果实，贮藏期可蔓延侵染其他果实；软腐病则从伤口侵染传播。一般情况下，常采取以下防治措施来防治侵染性病害的发生：
①防治与消毒，加强采前田间病害的防治及盛装容器等用具的消毒；
②避免损伤，尽量减少在采收、分级、包装和贮运等一系列操作过程中机械损伤的发生；
③快速预冷，将采收后的果品温度尽快降到4.5℃以下(软腐病菌在73℃以下即不能生长)，可有效地抑制褐腐病的发生；
④钙素处理，采收前15天喷施5%的氯化钙可起到增加李子表皮细胞膜的稳定性和完整性，抑制呼吸酶活性的作用，延缓其衰老，同时钙素具有抑制果胶酶活力的作用，能有效地防止果实变软；
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杀菌剂浸果，若常温条件下贮运李子，采收后可用100~1000mg/kg苯菌灵和450~1000mg/kg的氯硝基苯胺(DCNA)混合液浸果，前者主要防治褐腐病，后者对软腐病有特效；
⑥热水浸果，果实在52~53.8℃热水中浸泡2~2.5分钟，或46℃热水中浸5分钟，可杀死病菌孢子，也可在46℃温水中加100mg/kg苯菌灵
杀菌剂，浸果2~3分钟，晾干后入贮。
耕种帮提醒李子果实对二氧化碳气体很敏感，当二氧化碳的浓度高于5%时，易发生病害。表现为果皮褐斑、溃烂，果肉及维管束褐变，果实汁液少、生硬、风味异常，因此在贮藏过程中必须控制好各项气体指标。
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