辣椒分苗的主要目的：
1、减少育苗用地：辣椒苗期生长比较缓慢，育苗时间长，特别是2~4叶期前，苗小、生长慢，占地时间相对较长，浪费土地严重。因此，需要采取分苗措施，进行分段育苗，也即分苗前集中培育小苗，分苗后按栽培要求培育大苗，减少育苗前期的用地。
2、降低育苗费用：辣椒苗对温度要求比较高，特别是育苗前期，对高温的要求更为严格，低温期育苗如果不采取二段育苗法，增温和保温费用相对增高，用工量也增加，育苗费用较高。
3、增加侧根数量：辣椒苗主根受到伤害后，能够促进侧根的生长，扩大表土层中的根密度，有利于培育壮苗，也能够增加定植时辣椒苗的带根量，提早缓苗。
分苗对辣椒育苗的不利影响主要有：
1、分苗往往造成辣椒苗短时间内生长停滞或十分缓慢，延长育苗时间。一般每分苗一次，就需要5~7天的缓苗时间，育苗期也相应延长5~7天。
2、分苗次数过多，也容易引起根系过早衰老，反而不利于培育壮苗和增加侧根数量。
3、在辣椒苗的花芽分化期进行分苗，会由于分苗引起的辣椒苗短时的生长停滞以及生长势的削弱，而影响花芽的分化质量，增加短柱花的数量，将来引起大量的落花落果，并增加畸形果的数量。
4、辣椒苗分苗后的缓苗阶段容易造成叶片黄化、脱落，减少叶面积，不利于培育壮苗。
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