概括起来讲，辣椒播种时容易发生的问题主要有以下几个：
1、底水不足：该问题多发生于高畦面苗床育苗上。究其原因主要是由于高畦面苗床排水性好，积水困难，浇水量又小，浇水后水下渗时间短，渗水量不足所致。
解决高畦面苗床不易浇透水的主要措施是在高畦面苗床的四边筑一道土埂来挡水，并且浇水量要大，让水在畦面上存留一段时间，适宜的浇水量应是浇水后，至少有10厘米以上的畦土变成泥泞状态。
2、浇水不均匀：该问题发生的主要原因是畦面高低不平，高的地方水量偏少，渗水不足，湿度偏低，低洼处积水较多，渗水量较大，湿度也大。
畦面浇水不均匀不仅影响种子出苗的整齐性，而且也不利于苗床的水分管理。另外，低温期育苗时，低洼处还往往会由于地温偏低，透气不良发生烂种；高温期育苗，高燥处也容易提早变干燥，而导致种子落干。
避免苗床浇水不均匀，首先应提高育苗畦的制作质量，使畦面保持平整；其次，育苗畦的规格大小要适宜，育苗畦过宽或过长，均不利于均匀浇水；第三，要提高浇水的质量。育苗畦较长时，应采取分段浇水法；畦面高低不平时，应采取局部补浇水法，减少差异。
3、糊种：也即播种后，种子被湿泥包裹住。糊种容易导致种子通气不良，缺氧而发生烂种。
避免糊种的最好办法就是在浇水后，先将畦面上均匀撒盖一层过筛的干细育苗土，待水洇湿干土后再进行播种，把种子播到湿润而疏松的护种土层内。
4、播种不均匀：播种不均匀的主要原因是辣椒种子的体积较小、重量较轻，种子不易散开所致。另外，辣椒种子(特别是湿种子)容易发生粘连结块，也是不易均匀播种的主要原因之一。
避免播种不均匀的主要措施是用细土或细沙把种子充分稀释后，再进行播种。
5、播种后盖土过深或过浅：盖土过深或过浅的主要原因是不了解辣椒种对覆土厚度的要求。辣椒种子较小，顶土力比较弱，不易出苗，应适当浅覆土，适宜的覆土厚度为05~1厘米。
覆土过浅，畦面表土容易失水变干燥，引起种子落干，既使不落干，种芽也容易顶着种壳出土，形成“带帽苗”。覆土过深，种子出苗晚，出苗率降低。视育苗季节不同，生产上一般将辣椒种的覆土厚度保持在1厘米左右为宜。
6、播种后覆土不匀：畦面覆土不均匀的主要原因是撒土方法不当。目前，苗畦撒土主要采取的是手撒土法，由于该撒土法不易掌握落土量以及落土范围较窄等原因，容易出现覆土不均匀现象。苗床覆土厚度差异明显时，往往造成出苗不整齐，并伴有落干、烂种等一系列问题。
避免苗床覆土不均匀，应采取筛土法，利用筛子易于掌握落土量以及落土均匀、落土范围大等优点，提高覆土的质量。
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