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灵芝是由菌丝体和子实体两大部分组成的。
下部长在营养基物里的白色丝状物叫菌丝体，菌丝体呈白色绒毛状，直径1到3微米。上部的伞状物叫子实体，它是灵芝的繁殖器官，由菌盖和菌柄、子实层三部分组成。成熟的灵芝子实体木质化，有红褐色漆状光泽；菌盖多为肾形、扇形或半圆形。菌盖下方多孔结构叫子实层，在放大镜下观察，有无数管状小孔，灵芝的孢子就从小管内产生。
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